La más reciente ocurrió este 4 de julio de 2022 cuando la Línea 2 tuvo una suspensión de servicio por un cortocircuito, que causó un incendio, entre las estaciones Xola y Villa de Cortés. 1,300 personas fueron desalojadas (algunas por las vías).
Las autoridades trabajaron en restablecer el servicio dos horas después. La fiscalía General de Justicia de la Ciudad de México (FGJCDMX) investiga las causas del incidente que, hasta el momento, indica haber sido causado por un objeto externo.
Antes hubo problemas relacionados directamente con el funcionamiento del metro.
3 de mayo de 2021, desplome de la Línea 12: El viaducto elevado, en el tramo entre la estación Tezonco y Olivos, se desplomó causando la muerte de 26 personas. Las razones del incidente aún son investigadas.
El informe de la empresa noruega DNV se explica que deficiencias en la construcción, así como falta de mantenimiento, provocaron el derrumbe.
28 de abril de 2021, tren averiado: En la Línea 8, cerca de la estación Escuadrón 201, el tren se detuvo y usuarios que viajaban en él tuvieron que salir y caminar por el túnel a oscuras.
A través de redes sociales reportaron la situación y el paro de circulación durante 40 minutos. El STC informó que se retiró el tren para normalizar la marcha.
10 de febrero de 2021, incendio de un tren: Ocurrió en la estación Indios Verdes. Cuando los vagones estaban en el andén y los usuarios lo abordaban, hubo un flamazo que nació en una de las llantas del vehículo, por lo que las personas salieron de inmediato.
